音量が大きすぎたのでAlsamixerで設定したのだが、再起動の度に戻ってしまっていた。
どうもPulseaudioのモジュールが設定をいじってしまうようだったので、/etc/pulse/default.paを編集して、module-alsa-sinkを有効に、module-udev-detectを無効にすると設定がいじられないようになった。
##この行を有効に load-module module-alsa-sink ##このモジュールを無効に #load-module module-udev-detect
あとで入力の方の設定もする予定。